Мораторий снят: как IT-компаниям готовиться к выездным проверкам и доначислениям

С марта 2025 года налоговые органы снова активно проводят выездные проверки в отношении IT-компаний, что становится особенно актуальным для организаций, получивших налоговые льготы и субсидии. В статье от команды проекта 42Clouds мы подробно рассмотрим, что изменилось после снятия моратория, на что будут обращать внимание налоговые инспекторы, какие документы потребуются для проверки и как минимизировать риски штрафов и доначислений.

Выездные налоговые проверки в 2025 году: кто попадает под проверку?

После снятия моратория на выездные проверки с марта 2025 года налоговые органы усиливают контроль за всеми налогоплательщиками, в том числе за малыми и средними IT-компаниями, которые использовали льготы. Теперь налоговые инспекторы будут проверять компании, соблюдают ли они все требования аккредитации, а также правомерность применения налоговых льгот.

Мораторий был снят без особого шума, однако в 2025 году можно ожидать новые разъяснения от ФНС и активизацию проверок. Налоговики будут обращать внимание на:

Состояние занятости сотрудников.
Наличие реальных IT-разработок.
Применение "серых" схем оплаты труда.

Причины повышенного внимания к IT-компаниям со стороны налоговых органов

Налоговые органы начинают проводить более жесткие проверки, так как в последние два года IT-компании активно использовали налоговые льготы и субсидии. Это привлекло внимание, так как налоговые органы опасаются возможных нарушений в части агрессивных схем налоговой оптимизации и фальсификаций. Компании, работающие с двойной бухгалтерией или использующие схемы вывода прибыли, оказались под пристальным вниманием.

ФНС проверяет не только льготы по страховым взносам, но и другие налоговые вычеты, субсидии от регионов и правомерность применения пониженных ставок налога на прибыль. С 2024 года около 17% IT-компаний не прошли автоматическую сверку с требованиями для аккредитации.

Налоговые проверки IT-компаний: что изменилось в 2025 году?

После снятия моратория ФНС изменила подход к выбору компаний для выездных проверок. Раньше проверки назначались по жалобам или на основании выявленных нарушений. Теперь налоговая служба использует цифровой подход — автоматизированную аналитику для оценки рисков.

В 2025 году компаниям, которые:

Получили субсидии, но не подтвердили занятость,
Продемонстрировали резкое снижение налоговой нагрузки,
Не раскрыли расходы на IT-разработку,
Работают с подрядчиками из "рисковой" категории,

угрожает попасть под проверку.

Как автоматизация отчетности помогает снизить налоговые риски?

Компании, которые используют автоматизацию для ведения отчетности, демонстрируют большую прозрачность в документации и снижает риск возникновения налоговых претензий. Исключение ручного ввода данных, таких как декларации, расчетные справки и отчеты, помогает избежать множества ошибок.

Облачные решения, такие как продукты 1С, позволяют оперативно обновлять данные согласно изменениям законодательства, и могут предупреждать пользователей о возможных несоответствиях в документации.

Налоговые риски для IT-компаний после отмены налоговых льгот

После отмены налоговых льгот, которые действовали с 2022 года, ФНС начинает активно пересматривать основания для их предоставления. Проверки охватывают не только льготы по налогам, но и расходы компаний, которые получили льготы, субсидии и вычеты.

Налоговая инспекция внимательно проверяет:

Соответствие заявленных видов деятельности и фактической работы компании.
Наличие сотрудников, задействованных в IT-разработке.
Применение вычетов по НДС, налогам на прибыль, страховым взносам и субсидиям.

Компаниям, которые используют неофициальные схемы или занижают расходы, предстоит сложный процесс проверки.

Доначисления налогов: что будет проверять ФНС в 2025 году?

В 2025 году основными причинами доначислений становятся:

Неправомерные контракты с индивидуальными предпринимателями и физическими лицами.
Замена реальных разработок на консультирование.
Завышение затрат на НИОКР без документов, подтверждающих эти расходы.
Ошибки в отчетности по льготам и взносам.

Даже если компания не имела намерения нарушать налоговое законодательство, отсутствие точных данных или несоответствие отчетности нормативам может привести к штрафам и доначислениям.

Как избежать штрафов: какие наказания ожидают при выявленных нарушениях?

При выявлении нарушений в ходе выездной или камеральной проверки ФНС компания может быть привлечена к различным видам ответственности:

Налоговая ответственность — штрафы за неполную уплату налогов могут составлять до 40% от суммы, которую не уплатили.
Административные штрафы — за неуплату налогов или отсутствие отчетности штрафы могут варьироваться от 300 до 20 000 рублей для должностных лиц. При повторных нарушениях наказания могут стать более серьезными, вплоть до запрета на ведение бизнеса.
Уголовная ответственность — если сумма неуплаченных налогов превышает 2,7 млн рублей для ИП или 18,75 млн рублей для руководителей организаций, возможна уголовная ответственность.

Как готовиться к проверке и что запросит ФНС?

Если ваша компания попала под риск выездной проверки, необходимо заранее подготовиться. Проверки затронут не только отчетность, но и внутренние бизнес-процессы.

ФНС может запросить следующие документы:

Штатное расписание и табели учета рабочего времени.
Договоры с заказчиками, подрядчиками и ИП.
Технические задания и описание проектов.
Расчеты налоговой базы, подтверждающие использование льгот.
Документы по субсидиям и налоговым вычетам.

ФНС также интересуется цифровыми следами: переписками в корпоративной почте, документами в облачных хранилищах и другими электронными записями. Компании с прозрачной цифровой инфраструктурой имеют меньший риск доначислений.

Что должно быть в договоре и отчетности?

Для того чтобы пройти проверку без проблем, необходимо привести в порядок следующие документы:

Договоры — должны содержать точные данные о сроках, ценах и обязательствах сторон.
Акты — необходимы по каждому этапу выполнения работ.
Сметы и расчеты — особенно для НИОКР и льготных видов деятельности.
Штат — наличие квалифицированных IT-специалистов должно быть подтверждено.

Как снизить налоговые риски легально

После снятия льгот для IT-компаний необходимо пересмотреть свою налоговую стратегию, чтобы избежать штрафов и доначислений. Есть несколько легальных способов оптимизации налогообложения:

Деление бизнеса по видам деятельности — можно выделить IT-разработку в отдельное юридическое лицо, соответствующее требованиям для аккредитации.
Патентная система или УСН для непрофильных направлений — позволяет уменьшить налоговую нагрузку на неосновные виды деятельности.

Как автоматизация и контроль расчетов могут снизить риски?

Для снижения рисков и предотвращения ошибок в расчетах важно внедрить системы для автоматического учета налогов, взносов и субсидий. Использование облачных решений помогает работать в защищенной среде, сверяя данные с актуальными нормативами.

Что делать, если проверка ФНС уже назначена?

Если вы получили уведомление о выездной проверке, не паникуйте, а начинайте подготовку:

Назначьте ответственного сотрудника или юриста по взаимодействию с налоговыми органами.
Подготовьте все необходимые договоры, отчеты, акты и налоговые регистры.
Проверьте все документы в электронном виде, включая переписку и CRM-систему.

Кроме того, проконсультируйтесь с профессионалом, чтобы заранее выявить возможные риски.

Поддержка и сопровождение: кому доверить налоговую безопасность?

Если в вашей компании нет штатного специалиста по налогообложению, стоит привлечь внешнего консультанта, который понимает специфику IT-бизнеса. Современные облачные решения помогут вам централизованно управлять данными и защитят от типичных ошибок.