О генетическом тестировании наследственных мутаций после аллогенной трансплантации
1. Буккальный эпителий. Удобно, просто, малоинвазивно. Чтобы собрать материал, понадобится пробирка и ватная палочка или щётка. Эпителий щеки часто анализируют для установления отцовства или изучения происхождения. Но подойдет ли он, чтобы оценить наследственные мутации? (дело не в том, что в этих клетках какая-то "другая" ДНК, а в том, можно ли из соскоба собрать достаточное количество ДНК и будет ли она достаточной сохранности).
Есть исследование, в котором с помощью NGS оценивали гены BRCA1/2 у пациенток с high-grade серозной карциномой яичников, сравнивая кровь и буккальный эпителий в качестве источника ДНК. Разницы не обнаружили. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1048891X24007199?utm_source=perplexity
Поэтому да, эпителий щеки подойдет для оценки наследственных мутаций. Но, если вы захотите направить его на исследование, стоит уточнить, работает ли данная лаборатория с подобным материалом.
Напомню, что наследственные мутации присутствуют в половых клетках, а значит, есть и в зиготе, из которой и будет развиваться весь организм. Поэтому искать их можно в любых клетках.
2. Кровь. Стандартный материал для генетического исследования наследственных мутаций, но НЕ подходящий в нашем случае. Суть аллогенной трансплантации в том, что кроветворение пациента заменяется на кроветворение донора. Поэтому в крови пациентов присутствуют клетки донора и клетки реципиента (химеризм). При полном или смешанном химеризме мы получим из крови, скорее, ДНК донора, и узнаем, присутствуют ли у него наследственные мутации. Исключением будет ситуация, если донором пациента был его однояйцевый близнец.
Кстати, после трансплантации химеризм (если его можно так назвать в данном случае) присутствует не только в клетках крови. В этом исследовании анализировали соотношение ДНК донора и реципиента в таких тканях, как буккальный эпителий, ногти и брови у пациентов после аллогенной трансплантации (то есть именно в тех тканях, которые направляются на генетическое исследование наследственных мутаций по той причине, что кровь уже не подойдет). Оказалось, что в наименьшем количестве ДНК донора "пробралась" в волосяные фолликулы бровей. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.01.20.630521v1.full
"Notably, nail and buccal swab tissues exhibit high levels of donor derived DNA with median values of 8 % (NGS) and 16 % (STR) for nails, and 20 % (NGS) and 24 % (STR) for buccal swab tissues, while eyebrow hair follicle samples display considerably lower levels with median levels of 1 % (NGS) and 3 % (STR)."
Есть ли смысл тестировать на наследственные мутации до начала терапии? Вероятно, это может быть целесообразно, если вы видите яркие признаки наличия какой-либо наследственной предрасположенности. С другой стороны, есть исследование, в котором показано, что у пациенток с РМЖ и мутацией в генах BRCA1/2 выше частота антрациклиновой кардиотоксичности https://academic.oup.com/oncolo/article/30/8/oyae299/7904824?login=false. Вероятно, подобная информация вряд ли кардинально изменит тактику лечения, но укажет на то, какие осложнения стоит ожидать. И будет полезна для родственников пациента, которым в таком случае тоже стоит выполнить исследование.
3. Опухолевые клетки. Если наследственные мутации присутствуют в каждой клетке организма, то они будут и в опухолевых клетках, которые когда-то всё-таки были "нормальными". Проблема в том, что в опухолевых клетках накапливаются и соматические мутации, а различить их не так уж и просто. Если будет обнаружен распространенный патогенный вариант, то можно предположить, что мутация имеет наследственный характер. Но для надежности необходимо сравнить с нормальной тканью. Из биопсийного или послеоперационного материала можно выделить нормальную ткань молочной железы и подтвердить мутацию в ней. Поэтому вариант с опухолевым материалом нельзя однозначно отнести к неправильным.
4. Тестирование родственников. Не позволит сказать ни да, ни нет. Если мутация есть у сестры, не факт, что она будет у самой пациентки. И наоборот. Но всё-таки мне не хочется называть этот вариант неправильным. Такую возможность как минимум стоит иметь в виду и при необходимости комбинировать с другими вариантами. И, кстати, если донором был родитель или сиблинг, можно взять кровь пациента и так протестировать родственника.