Настройка FreeOffice

Для начала стоит убрать создание резервных копий ваших файлов после редактирования которые автоматически создаются в формате bak.

Файл → Параметры → вкладка «Файлы» → установите «Без резервного копирования»

Шифрование Excel файла.
Файл → Управление файлами → Свойства → вкладка «Защита» → выбрать тип защиты (чтение/запись), установить "Наиболее защищёный" и задать пароль, затем сохранить документ