3d дескрипторы

2JHH

На геминальные константы влияют тип атома между водородами, кратные связи при нем (гибридизация атома), альфа и бета заместители, угол между водородами и орбитальные эффекты.

Однако существуют определенные трудности:

Сложно определить кратность связи
Необходимо понимать электронный эффект заместителя
Нужно как-то кодировать атом

В связи с этим я решил оценивать все эти эффекты следующим образом:

Так как всего у нас 5 атомов (H, C, N, O, F), то каждый атом можно кодировать через электроотрицательность. Для нормализации я решил взять разницу между F и H (3,98 - 2,2 = 1,78) и принять F = +1 H = -1, тогда C = -0,6088; N = -0,0562; O = 0,3932.
Взять самую длинную и самую короткую связи и таким же образом перевести от -1 (самая длинная связь) до 1 (самая короткая связь), где 0 может быть отсутствием связи (но не всегда). Таким образом мы будем учитывать кратность связи.
Далее идем от атома при двух взаимодействующих водородов. Первый дескриптор - просто полученное значение атома (шаг 1)
Затем мы смотрим всех его соседей и расстояния до них. Усредняем и расстояния, и соседей. На картинке усреднение происходит между всеми A3 (один дескриптор) и их связями с A2 (тоже один дескриптор), аналогичным образом получаем еще два дескриптора из A2 и их связей с A1, и напоследок сам A1. Итого 5 дескрипторов, которые меняются в зависимости от электроотрицательности и длины связи.