Ингибиторы гистондеацетилаз (HDAC)
В новом исследовании биологи изучили класс противоопухолевых лекарств, известных как ингибиторы гистондеацетилаз (HDAC)
Эти соединения блокируют ферменты, регулирующие активность генов, которые способствуют формированию клеток опухолей
Эти бактерии умеют естественным образом производить целые семейства таких близкородственных соединений, однако ученые долгое время не понимали, как именно координируется работа ферментов при «сборке» сложных молекул (депсипептидов)
Исследовательская группа из Уорикского университета (Великобритания) применила комплексный подход: от компьютерного моделирования до масс-спектрометрии и направленного мутагенеза
Они разобрались, как бактерии Pseudomonas chlororaphis создают природный антибиотик FR-901375
Ключом к гибкому производству молекул оказались так называемые стыковочные домены (docking domains)
Они служат связующим звеном — как детали пазла между основными белковыми блоками и ферментами, завершающими сборку вещества
У этих доменов есть общая точка связи, за счет чего они могут гибко взаимодействовать со множеством разных ферментов-партнеров
Благодаря такому модульному устройству бактерии безболезненно меняют компоненты молекулы на финальном этапе сборки, сохраняя при этом точность остальной структуры, необходимую для сохранения терапевтического эффекта