Важно! Маршрутизация в режиме TUN, для режима системного прокси работают другие правила.
Для решения данной задачи предлагаем ознакомиться с данной статьей, в которой подробно описано что делать https://telegra.ph/Marshrutizaciya-v-NekoRay-rezhim-TUN-12-10
Если галочки нет, значит конфиг не запущен и нужно его запустить. Нажать на конфиг правой кнопкой мыши и в открывшемся подменю нажать "Запустить"