Генетический анализ
После серии заметок о генетическом анализе происхождения человечества (https://teletype.in/@tambov_wolf/537017) следующим логическим шагом было попробовать это дело самому.
Купил на распродаже ДНК-тест на www.MyHeritage.com за $49. По почте пришла коробочка с ватной палочкой и ампулой, ватной палочкой поковырял за щекой, запечатал в ампулу и отослал по почте же (ампул и палочек на самом деле 2 - для каждой щеки, на случай если что-то пойдёт не так при анализе первой).
Через месяц опубликовали результаты. Выглядят, для меня, они вот так:
Так как у меня несколько близких родственников уже воспользовались именно этим провайдером и их результаты были в базе, то, соответственно, меня уведомили что у меня нашлись родственники. Степень близкого родства определили хорошо, в результатах, правда, полно (~250) каких-то левых людей которые помечены как мои пятиюродные родственники.
Надо заметить что это не Y-DNA и не mtDNA тест, то есть, если я правильно понимаю, просто какой-то набор отрезков моих хромосом, выбранный провайдером, который они анализируют на совпадения с собственными моделями и своей базой пользователей.
Подробные результаты (о них позднее) MyHeritage можно загрузить на https://www.gedmatch.com (полный анализ для поиска родственников может занять пару дней).
Сразу же после загрузки можно проанализировать своё происхождение с помощью разных моделей (Analyse My Data -> Admixture (heritage), (руководство пользователя: http://genealogical-musings.blogspot.com/2017/04/finally-gedmatch-admixture-guide.html), вот например что даёт мне анализ по базе представителей тринадцати (К13) европейских (Eurogenes) популяций:
Admixture (heritage) -> Eurogenes -> K13:
Population North_Atlantic 19.35 Baltic 36.23 West_Med 8.27 West_Asian 16.93 East_Med 9.64 Red_Sea 1.83 South_Asian 2.03 East_Asian - Siberian 3.42 Amerindian 0.27 Oceanian 1.24 Northeast_African - Sub-Saharan 0.78
Забавная кнопочка Oracle-4 выдает табличку в которой алгоритм пытается предположить какие популяции поучаствовали в моём генетическом портрете:
Mixed Mode Population Sharing:
#
Primary Population (source)
Secondary Population (source)
Distance
1
69.2%
Southwest_Russian
+
30.8%
Kumyk
@
2.37
2
64.2%
Estonian_Polish
+
35.8%
Kumyk
@
2.58
3
71%
Southwest_Russian
+
29%
Balkar
@
2.72
4
69.8%
Southwest_Russian
+
30.2%
Kabardin
@
2.77
5
71.3%
Southwest_Russian
+
28.7%
Adygei
@
2.79
6
76.4%
Southwest_Russian
+
23.6%
Abhkasian
@
2.88
7
75.4%
Southwest_Russian
+
24.6%
Georgian
@
2.93
8
73.1%
Southwest_Russian
+
26.9%
Ossetian
@
3.01
9
71.9%
Southwest_Russian
+
28.1%
North_Ossetian
@
3.03
10
63.4%
Belorussian
+
36.6%
Kumyk
@
3.05
11
66.1%
Estonian_Polish
+
33.9%
Balkar
@
3.06
12
66.5%
Estonian_Polish
+
33.5%
Adygei
@
3.07
13
72.1%
Estonian_Polish
+
27.9%
Abhkasian
@
3.13
14
64.8%
Estonian_Polish
+
35.2%
Kabardin
@
3.16
15
65.6%
Russian_Smolensk
+
34.4%
Kumyk
@
3.19
16
65.4%
Belorussian
+
34.6%
Balkar
@
3.24
17
70.3%
Ukrainian_Belgorod
+
29.7%
Kumyk
@
3.32
18
67.1%
Estonian_Polish
+
32.9%
North_Ossetian
@
3.33
19
64.1%
Belorussian
+
35.9%
Kabardin
@
3.36
20
71%
Estonian_Polish
+
29%
Georgian
@
3.37
Заодно нашлась, похоже, модель на основе которой MyHeritage анализировал мои результаты:
Admixture (heritage) -> Eurogenes -> Jtest: это модифицированная модель K13 в которой введена новая группа Ашкенази и делается попытка генетически распознать евреев, подробнее о модели можно почитать на http://bga101.blogspot.com.au/2012/09/eurogenes-ashkenazim-ancestry-test-files.html, а в целом, о проблеме распознавания евреев я писал в https://teletype.in/@tambov_wolf/541517
Population
SOUTH_BALTIC
25.42
EAST_EURO
18.82
NORTH-CENTRAL_EURO
9.69
ATLANTIC
11.06
WEST_MED
3.66
ASHKENAZI
4.92
EAST_MED
7.73
WEST_ASIAN
12.50
MIDDLE_EASTERN
1.06
SOUTH_ASIAN
2.26
EAST_AFRICAN
-
EAST_ASIAN
-
SIBERIAN
2.52
WEST_AFRICAN
0.35
Ну и подробный анализ по 36 [преимущественно европейским и переднеазиатским] популяциям:
Amerindian
-
Arabian
-
Armenian
4.56
Basque
0.35
Central_African
-
Central_Euro
9.18
East_African
-
East_Asian
-
East_Balkan
0.96
East_Central_Asian
0.30
East_Central_Euro
16.44
East_Med
3.22
Eastern_Euro
14.98
Fennoscandian
10.46
French
-
Iberian
5.73
Indo-Chinese
-
Italian
5.03
Malayan
-
Near_Eastern
-
North_African
-
North_Atlantic
3.25
North_Caucasian
14.49
North_Sea
3.02
Northeast_African
0.29
Oceanian
0.68
Omotic
-
Pygmy
-
Siberian
-
South_Asian
-
South_Central_Asian
3.26
South_Chinese
-
Volga-Ural
2.31
West_African
0.31
West_Caucasian
1.11
West_Med
-